财政部台北国税局表示，营利事业出售属所得税法第4条之1规定之股票，其证券交易所得减除股票交易损失余额为正数者，虽可免纳所得税，但应计入当年度基本所得额，其中出售之股票持有期间满3年者，得以减除当年度出售该持有满3年股票交易损失后之正数余额之半数计入，而其持有期间之计算，采先进先出法核算。

该局举例说明，A公司分别於106年1月1日及108年7月1日以每股80元购入B公司股票10万股及30万股，嗣於109年3月1日以每股100元出售B公司股票15万股，按先进先出法计算持有期间，其中10万股系出售106年1月1日所购入的股票，属持有期间满3年以上，可适用减半计入基本所得额之证券交易所得为200万元〔（100元－80元）×10万股〕；其余5万股系出售108年7月1日所购入的股票，属持有期间未满3年，不可适用减半课税规定，因此证券交易所得100万元〔（100元－80元）×5万股〕应全数计入基本所得额。A公司110年5月办理109年度基本税额申报时，其应计入基本所得额之证券交易所得为200万元〔（200万元/2）+100万元〕。